Fibrosis quística
Vengono segnalate solo le varianti associate alla fibrosi cistica classica. La regione polimorfica dell’introne 8 del gene CFTR (allele 5T) viene riportata solo se viene rilevata la variante NM_000492.4:c.350G>A (p.Arg117His).
Alfa talassemia
Non viene effettuata l’analisi dell’intero gene. Varianti incluse: –MED; –SEA; –THAI; –α3.7; –α4.2; –α20.5; –FIL; Hb Constant Spring (NM_000517.4:c.427T>C).
Fenilchetonuria
Sordità autosomica recessiva tipo 1A
Le varianti associate a un fenotipo lieve non vengono segnalate.
Sindrome di Jervell e Lange-Nielsen
Sindrome di Usher tipo 1D; Sordità autosomica recessiva tipo 12
Atrofia muscolare spinale
Viene inclusa solo la delezione dell’esone 7 nel gene SMN1. Non viene effettuata la sequenza né l’analisi di delezione/duplicazione in altre regioni di questo gene. Questo test non rileva portatori “silenziosi” di SMA, che hanno due copie del gene SMN1 su un cromosoma e nessuna sull’altro.
Deficit di diidropirimidina deidrogenasi
Deficit di acil-CoA deidrogenasi a catena media
Pseudoxantoma elastico; Calcificazione arteriosa generalizzata dell'infanzia tipo 2
Immunodeficienza combinata da deficit di DOCK8
Sindrome di Senior-Loken tipo 1; Nefronoftisi tipo 1; Sindrome di Joubert tipo 4
Le delezioni in questo gene non saranno riportate, poiché la bassa penetranza riportata ne limita l’utilità clinica.
Albinismo oculocutaneo tipo 1A/1B
La variante ipomorfa NM_000372.5:c.1205G>A, p.(Arg402Gln), associata a manifestazioni cliniche più lievi, non viene segnalata.
Beta talassemia; Anemia a cellule falciformi
Disturbo congenito della glicosilazione tipo 1A
Sindrome di Ellis-Van Creveld
Malattia di Wilson
Malattia di Pompe
Sindrome di Seckel tipo 1
Sindrome di Crigler-Najjar tipo 1 e 2
Non vengono segnalate varianti nel gene UGT1A1 associate alla sindrome di Gilbert.
Mucopolisaccaridosi, tipo 1
Sindrome di Ehlers-Danlos tipo 6
Microcefalia primaria autosomica recessiva tipo 9; Sindrome di Seckel tipo 5
Sindrome PEHO
Cistinose nefropatica
Acidemia metilmalonica con omocistinuria tipo cblC
Sequenza di deformazione da acinesia fetale tipo 2; Sindrome miastenica congenita tipo 11
Síndrome X Frágil
Vengono analizzate le ripetizioni del trinucleotide CGG nel 5’ UTR. Vengono segnalati solo gli alleli in mutazione completa (>200 ripetizioni) e premutazione (55–200 ripetizioni). Il mosaicismo, incluso quello gonadico, potrebbe non essere rilevato.
Sindrome di Usher tipo 2
Glomerulosclerosi segmentaria e focale tipo 9; Ventricolomegalia-malattia cistica renale
Deficit primitivo sistemico di carnitina
Malattia di Krabbe
Sindrome miastenica congenita tipo 12
Albinismo oculocutaneo, tipo 2
Sindrome di Aicardi-Goutières tipo 2
Aciduria glutarica di tipo 1
Sindrome di Alport tipo 3B
Amaurosi congenita di Leber tipo 8; Retinite pigmentosa tipo 12
Retinosis pigmentaria tipo 25
Anemia di Fanconi gruppo A
Sindrome di Fraser tipo 1
Deficit di acil-CoA deidrogenasi a catena molto lunga
Sindrome nefrosica tipo 1
Deficit di biotinidasi
La variante NM_001370658.1:c.1270G>C (p.Asp424His) non viene segnalata a causa della bassa penetranza e della sua associazione a ridotta attività enzimatica in stato omozigote.
Sindrome da iperimmunoglobulinemia D; Aciduria mevalonica
Carenza di carnitina palmitoiltransferasi di tipo 2
Linfoistiocitosi emofagocitica familiare tipo 2
Iperplasia surrenalica congenita classica da deficit di 21-idrossilasi
Non viene effettuata l’analisi completa del gene. Varianti incluse: NM_000500.9:c.293‑13C/A>G, NM_000500.9:c.332_339del, NM_000500.9:c.518T>A, NM_000500.9:c.710T>A, NM_000500.9:c.713T>A, NM_000500.9:c.719T>A, NM_000500.9:c.923dup, NM_000500.9:c.955C>T, NM_000500.9:c.1069C>T, delezione di 30 kb, grande conversione genica. La variante NM_000500.9:c.955C>T viene segnalata solo se non viene rilevata duplicazione del gene CYP21A2. Questa variante insieme alla duplicazione è spesso presente sullo stesso cromosoma (in cis), risultando in due copie funzionali del gene. In tali casi, l’individuo non è considerato portatore di iperplasia surrenalica congenita (Parajes et al., 2008; Kleinle et al., 2009).
Sindrome di Coats plus
Galattosemia
Sindrome di Cohen
Deficit di HMG-CoA liasi
Poliendocrinopatia autoimmune tipo 1
Hemofilia A
È inclusa anche la rilevazione dell’inversione dell’introne 22 nel gene F8.
Sindrome da bassa statura-atrofia ottica-anomalia di Pelger-Huët; Insufficienza epatica acuta infantile associata alla febbre
Síndrome de Shwachman-Diamond tipo 1
Neurodegenerazione associata a pantotenato chinasi tipo 1
Sindrome di Knobloch tipo 1
Disturbo dello sviluppo intellettivo legato all'X, tipo Tuner
Encefalopatia da glicina tipo 1
Acidemia metilmalonica tipo mut0
Malattia di Niemann-Pick tipo A/B
Acidemia propionica
Malattia di Niemann-Pick tipo C1/D
Sindrome miastenica congenita tipo 4A, 4B, 4C
Malattie correlate al gene CC2D2A
Deficit di carbamil-fosfato sintetasi 1
Paraplegia spastica tipo 39; Sindrome di Oliver-McFarlane; Sindrome di Boucher-Neuhäuser
Deficit di 3-idrossiacil-CoA deidrogenasi a catena lunga; Deficit della proteina trifunzionale mitocondriale
Aciduria fumarica
Sindrome di Poretti-Boltshauser
Leucodistrofia ipomielinizzante tipo 11; Sindrome di Treacher-Collins tipo 3
Sindrome di Usher tipo 2A; Retinite pigmentosa tipo 39
Malattia renale policistica tipo 4
Displasia anauxetica tipo 1; Displasia metafisaria senza ipotricosi; Ipoplasia cartilagine-capelli
Glaucoma congenito tipo 3A; Disgenesia mesenchimale familiare del segmento anteriore dell'occhio
Sindrome di Wolfram tipo 1
Malattia di Sandhoff
Citrullinemia, tipo I
Sindrome di Cockayne tipo 1; Sindrome cerebro-oculo-facio-scheletrica tipo 1; Sindrome da ipersensibilità agli UV tipo 1
Nanismo primordiale osteodisplastico microcefalico, tipo 2
Sindrome di Usher tipo 1F; Sordità autosomica recessiva tipo 23
Sequenza dell'acinesia fetale; Sindrome miastenica congenita tipo 10
Sindrome di Smith-Lemli-Opitz
Malattie correlate al gene SLC26A2
Iperfenilalaninemia da deficit di DNAJC12
Malattie correlate al gene POLG
Sindrome di Goldmann-Favre; Retinite pigmentosa tipo 37
Pneumopatia interstiziale da deficit di ABCA3
Xantomatosi cerebrotendinea
Miopatia nemalinica tipo 2; Artrogriposi multipla congenita tipo 6
Deficit primario di coenzima Q10 tipo 4
Malattia delle urine a sciroppo d'acero tipo 1A
Albinismo oculare recessivo legato all'X; Nistagmo congenito tipo 6
Colestasi intraepatica familiare progressiva, tipo 2
Sindrome costa corta-polidattilia, tipo 3
Deficit di alfa-N-acetilgalattosaminidasi tipo 1,2,3
Malattie correlate al gene TMEM67
Aciduria argininosuccinica
Distrofia muscolare degli arti prossimali tipo 3
Sindrome di Meckel tipo 5; Sindrome di Joubert tipo 7
Microcefalia primaria autosomica recessiva tipo 1
Distrofia Muscular di Duchenne; Distrofia muscolare di Becker
Sindrome di Omenn; Immunodeficienza combinata con granulomatosi; Immunodeficienza combinata grave dovuta a un deficit completo di RAG1/2
Malattia di Tay-Sachs
Atassia - telangectasia
Malattie correlate al gene FHL1
Miotonia congenita
Sordità autosomica recessiva tipo 3
Epilessia dipendente dalla piridossina tipo 4
Leucoencefalopatia con perdita della sostanza bianca tipo 5
Epidermolisi bollosa distrofica correlata al gene COL7A1
Malattia da accumulo di glicogeno tipo Ib, Ic
Sindrome di Usher tipo 1B; Sordità autosomica recessiva tipo 2
Ittiosi congenita tipo 1
Ipopofosfatasia infantile
Sclerosi laterale amiotrofica giovanile tipo 5; Malattia di Charcot-Marie-Tooth tipo 2X; Paraplegia spastica, tipo 11
Encefalopatia epilettica indeterminata ad esordio precoce
Sindrome di Baller-Gerold; Sindrome di Rothmund-Thomson tipo 2; Sindrome RAPADILINO
Diabete mellito neonatale isolato permanente tipo 3; Ipoglicemia familiare iperinsulinemica tipo 1
Sindrome di Zellweger 1A/B; Sindrome di Heimler 1
Sindrome letale da pterigi multipli; Sindrome di Escobar
Distrofia dei coni e dei bastoncelli tipo 13; Amaurosi congenita di Leber tipo 6
Displasia mandiboloacrale; Distrofia muscolare di Emery-Dreifuss, tipo 3; Malattia di Charcot-Marie-Tooth, tipo 2B1
Distrofia neuroassonale infantile tipo 1; Distonia - parkinsonismo tipo Paisan-Ruiz; Neurodegenerazione con accumulo di ferro cerebrale tipo 2B
Ipoplasia pontocerebellare, tipo 6
Malattia di Salla; Malattia da accumulo di acido sialico libero, forma infantile
Malattia di Charcot-Marie-Tooth, tipo 4C
Intolleranza alle proteine con lisinuria
Sindrome letale da disfunzione mitocondriale multipla, tipo 1; Paraplegia spastica tipo 93
Sindrome di Behr
Calcinosi tumorale normofosfatemica familiare
Discheratosi congenita tipo 5
Distrofia muscolare degli arti tipo 2A
Sindrome di Pendred; Sordità autosomica recessiva tipo 4
Discinesia ciliare primaria tipo 1
Discinesia ciliare primaria tipo 3
Sindrome da deficit di creatina cerebrale tipo 3
Sindrome di Wiedemann-Rautenstrauch; Leucodistrofia ipomielinizzante tipo 7
Distrofia muscolare dei cingoli tipo 2B; Miopatia di Miyoshi; Miopatia distale con esordio nella tibiale anteriore
Sindrome di Joubert con difetto oro-facio-digitale; Sindrome di Joubert tipo 17
Anemia di Fanconi gruppo J
Iperossaluria primitiva, tipo 1
Ovaioleucodistrofia; Difetto combinato della fosforilazione ossidativa, tipo 8
Sindrome di Bardet-Biedl tipo 1
Malattia simil-atassia-telangectasia tipo 1
Deficienza del fattore I del complemento
Amaurosis congénita de Leber tipo 13
Atassia-aprassia oculomotoria tipo 4; Encefalopatia epilettica infantile precoce
Lipofuscinosi ceroidale neuronale tipo 1; Atassia spinocerebellare tipo 7
Amaurosi congenita di Leber tipo 9; Sindrome SHILCA
Deficit di succinico semialdeide deidrogenasi
Malattia da accumulo di glicogeno tipo 3A/3B
Sindrome di Adams-Oliver tipo 2
Malattia da accumulo di glicogeno tipo 1A
Mucopolisaccaridosi tipo 2
Pseudoipoaldosteronismo tipo 1B2
Sindrome di Alström
Paraplegia spastica tipo 5A; Difetto congenito della sintesi degli acidi biliari, tipo 3
Sindrome nefrosica tipo 2
Sordità autosomica recessiva tipo 77
Ittiosi congenita tipo 2
Discinesia ciliare primaria tipo 15
Miopatia, tipo Bethlem tipo 1C; Distrofia muscolare congenita di Ullrich tipo 1C; Distonia primitiva tipo DYT27
Epidermolisi bollosa giunzionale con atresia pilorica tipo 5B; Epidermolisi bollosa giunzionale generalizzata intermedia tipo 5A
Mucopolisaccaridosi tipo 6
Malattia di Charcot-Marie-Tooth, tipo 4K; Deficit isolato della citocromo C ossidasi
Sindrome GRACILE; Sindrome di Björnstad; Deficit isolato del complesso III
Sindrome di Sanfilippo tipo B
Microcefalia primaria autosomica recessiva tipo 5
Acidemia glutarica tipo 2C
Sindrome da rotture cromosomiche di Varsavia
Ipoplasia ponto-cerebellare di tipo 2 e 4
Discinesia ciliare primaria tipo 17
Malattia simile alla sindrome da rotture cromosomiche di Nijmegen
Albinismo oculocutaneo tipo 4
Ittiosi congenita tipo 3
Malattia delle urine a sciroppo d'acero tipo 1B
Distrofia muscolare dovuta a distroglicanopatia tipo 14A, 14B, 14C
Deficit combinato di fosforilazione ossidativa tipo 35
Sindrome di Carey-Fineman-Ziter
Trombocitopenia amegacariocitica congenita tipo 1
Malattia di Canavan
Ritardo dello sviluppo con disturbo dello spettro autistico e andatura instabile
Sindrome di Peters plus
Insufficienza cardiaca improvvisa nell’infanzia
Sindrome da insensibilità agli androgeni
Il metodo attuale non valuta le ripetizioni del trinucleotide CAG nell’esone 1 di questo gene.
Hemofilia B
Sindrome di Bardet-Biedl; Sindrome di Joubert; Sindrome di Meckel
Malattie correlate al gene CLCN5
Intolleranza ereditaria al fruttosio
Omocistinuria classica
Lipofuscinosi ceroidale neuronale tipo 1
Acromatopsia tipo 2
Malattie correlate al gene CEP290
La variante intronica profonda NM_025114.4:c.2991+1655A>G non è inclusa.
Distrofia muscolare-distroglucanopatia tipo 4A, 4B, 4C
Acromatopsia tipo 3
Distrofia muscolare-distroglucanopatia tipo 3A, 3B, 3C; Retinite pigmentosa tipo 76
Anemia di Fanconi gruppo C
Xeroderma pigmentoso gruppo D; Tricotiodistrofia tipo 1
Citrullinemia tipo 2
Disautonomia familiare
Sindrome di Wiskott-Aldrich; Neutropenia congenita grave legata all'X; Trombocitopenia legata all’X
Distrofia muscolare congenita da deficit di laminina alfa2
Discinesia ciliare primaria tipo 7
Leucodistrofia metacromatica
Malattia da accumulo di glicogeno tipo 4; Malattia da corpi di poliglucosano dell'adulto
Mucopolisaccaridosi tipo 4A
Gangliosidosi GM1 tipo 1,2,3; Mucopolisaccaridosi tipo 4B
Sindrome da contratture congenite letali, tipo 1; Artrogriposi letale con malattia delle cellule delle corna anteriori
Sindrome idroletale
Sindrome di Ivemark
Discinesia ciliare primaria tipo 13
Malattia da accumulo di glicogeno tipo 7
Deficit combinato della fosforilazione ossidativa tipo 3
Displasia ectodermica ipoidrotica tipo 1
Diarrea cronica congenita associata ad enteropatia con perdita di proteine
Acidemia isovalerica
Miopatia centronucleare legata al cromosoma X
Albinismo oculocutaneo di tipo 3
Diarrea congenita da cloruri
Deficit di E3 della piruvato deidrogenasi
Malattia da accumulo degli esteri del colesterolo; Malattia di Wolman
Sindrome miastenica congenita tipo 5
Sindrome di Usher tipo 3A
Mucolipidosi tipo 4
Malattie correlate al gene PRPS1
Sindrome di Alport tipo 1
Miopia tipo 6
Deficit di E1-beta della piruvato deidrogenasi
Retinosis pigmentaria tipo 59
Difetto combinato della fosforilazione ossidativa tipo 20
Nefronoftisi tipo 3; Displasia renale-epatico-pancreatica tipo 1; Sindrome di Meckel tipo 7
Distrofia muscolare-distroglucanopatia tipo 5A, 5B, 5C
Adrenomieloneuropatia
Coroideremia
Eterotassia legata al cromosoma X; VACTERL con idrocefalo
Malattia di Fabry
Malattie correlate al gene AIFM1
Sindrome IPEX
Sindrome di Bardet-Biedl tipo 10
Mucopolisaccaridosi di tipo 3
Retinoschisi
Distrofia muscolare congenita di Ullrich tipo 1B; Miopatia, tipo Bethlem tipo 1B
Anemia di Fanconi gruppo I
Síndrome de Joubert tipo 2; Sindrome di Meckel tipo 2; Retinite pigmentosa tipo 98
Sindrome tetraplegia spastica-assottigliamento del corpo calloso-microcefalia postnatale progressiva
Retinite pigmentosa tipo 74; Sindrome di Bardet-Biedl tipo 2
Aspartilglucosaminuria
Disturbo dello sviluppo intellettivo tipo 96
Sindrome TARP
Sindrome da anomalie congenite multiple, ipotonia e crisi epilettiche tipo 2; Sindrome ferro-cerebro-cutanea
Disturbo dello sviluppo intellettivo legato all’X tipo 97
Disturbo dello sviluppo intellettivo tipo 90
Deficit di E1-alfa della piruvato deidrogenasi
Sindrome di Renpenning
Distrofia muscolare di Emery-Dreifuss tipo 1
Vitreoretinopatia essudativa familiare; Malattia di Norrie
Sindrome da deficit di creatina cerebrale tipo 1
Disturbo dello sviluppo intellettivo legato all'X tipo 1
Cecità notturna stazionaria congenita tipo 1A
Sindrome di Allan-Herndon-Dudley
Disturbo dello sviluppo intellettivo sindromico legato all'X correlato a KDM5C
Malattie correlate al gene FLNA
Sindrome MASA; Idrocefalo con stenosi dell'acquedotto di Silvio
Amaurosi congenita di Leber tipo 1; Distrofia dei coni e bastoncelli tipo 6; Cecità notturna congenita stazionaria tipo 1I
Sindrome ATR-X
Immunodeficienza 34; Malattia granulomatosa cronica
Deficit isolato dell'ormone della crescita, tipo 3; Agammaglobulinemia legata all'X
Sindrome di Barth
Malattie correlate al gene MECP2
Malattia infiammatoria intestinale a esordio precoce correlata a IL10 tipo 28
Sindrome di Joubert tipo 10
Lissencefalia, tipo 1; Eterotopia a banda sottocorticale
Sindrome del nanismo di Mulibrey
Disturbo dello sviluppo intellettivo legato all’X tipo 98
Sindrome linfoproliferativa legata all'X tipo 2
Disturbo dello sviluppo intellettivo sindromico tipo 14
Epilessia legata all'X - disturbi dell'apprendimento - disturbi del comportamento; Disturbo dello sviluppo intellettivo legato all’X tipo 50
Sindrome di Kelley-Seegmiller; Sindrome di Lesch-Nyhan
Disturbo dello sviluppo intellettivo legato all'X tipo 21
Disturbo dello sviluppo intellettivo legato all’X tipo Cabezas
Malattia di Dent tipo 2; Sindrome di Lowe
Immunodeficienza con iper-IgM tipo 1
Deficit di ornitina transcarbamilasi
Sindrome FG, tipo 4; Disturbo dello sviluppo intellettivo legato all’X, tipo Najm
Sindrome di Meester-Loeys; Displasia spondiloepimetafisaria legata all'X
Cheratosi follicolare spinulosa decalvante di Siemens; Ittiosi follicolare - alopecia - fotofobia; Osteogenesi imperfetta tipo 19
Disturbo dello sviluppo intellettivo tipo 99
Immunodeficienza combinata legata al cromosoma X
Sordità autosomica recessiva tipo 1B
Le varianti associate a un fenotipo lieve non vengono segnalate.
Sindrome di Usher tipo 2
Eritrocheratodermia variabilis tipo 1
Le varianti associate a un fenotipo lieve non vengono segnalate.