Fibrosis quística
Vengono segnalate solo le varianti associate alla fibrosi cistica classica. La regione polimorfica dell’introne 8 del gene CFTR (allele 5T) viene riportata solo se viene rilevata la variante NM_000492.4:c.350G>A (p.Arg117His).
Alfa talassemia
Non viene effettuata l’analisi dell’intero gene. Varianti incluse: –MED; –SEA; –THAI; –α3.7; –α4.2; –α20.5; –FIL; Hb Constant Spring (NM_000517.4:c.427T>C).
Albinismo oculocutaneo tipo 1A/1B
La variante ipomorfa NM_000372.5:c.1205G>A, p.(Arg402Gln), associata a manifestazioni cliniche più lievi, non viene segnalata.
Beta talassemia; Anemia a cellule falciformi
Disturbo congenito della glicosilazione tipo 1A
Sindrome di Ellis-Van Creveld
Malattia di Wilson
Malattia di Pompe
Sindrome di Crigler-Najjar tipo 1 e 2
Non vengono segnalate varianti nel gene UGT1A1 associate alla sindrome di Gilbert.
Acidemia metilmalonica con omocistinuria tipo cblC
Síndrome X Frágil
Vengono analizzate le ripetizioni del trinucleotide CGG nel 5’ UTR. Vengono segnalati solo gli alleli in mutazione completa (>200 ripetizioni) e premutazione (55–200 ripetizioni). Il mosaicismo, incluso quello gonadico, potrebbe non essere rilevato.
Deficit primitivo sistemico di carnitina
Malattia di Krabbe
Sindrome miastenica congenita tipo 12
Albinismo oculocutaneo, tipo 2
Sindrome di Aicardi-Goutières tipo 2
Aciduria glutarica di tipo 1
Sindrome di Alport tipo 3B
Amaurosi congenita di Leber tipo 8; Retinite pigmentosa tipo 12
Retinosis pigmentaria tipo 25
Deficit di acil-CoA deidrogenasi a catena molto lunga
Sindrome nefrosica tipo 1
Deficit di biotinidasi
La variante NM_001370658.1:c.1270G>C (p.Asp424His) non viene segnalata a causa della bassa penetranza e della sua associazione a ridotta attività enzimatica in stato omozigote.
Carenza di carnitina palmitoiltransferasi di tipo 2
Iperplasia surrenalica congenita classica da deficit di 21-idrossilasi
Non viene effettuata l’analisi completa del gene. Varianti incluse: NM_000500.9:c.293‑13C/A>G, NM_000500.9:c.332_339del, NM_000500.9:c.518T>A, NM_000500.9:c.710T>A, NM_000500.9:c.713T>A, NM_000500.9:c.719T>A, NM_000500.9:c.923dup, NM_000500.9:c.955C>T, NM_000500.9:c.1069C>T, delezione di 30kb, grande conversione genica. La variante NM_000500.9:c.955C>T viene segnalata solo se non viene rilevata duplicazione del gene CYP21A2. Questa variante insieme alla duplicazione è spesso presente sullo stesso cromosoma (in cis), risultando in due copie funzionali del gene. In tali casi, l’individuo non è considerato portatore di iperplasia surrenalica congenita (Parajes et al., 2008; Kleinle et al., 2009).
Malattia renale policistica tipo 4
Displasia anauxetica tipo 1; Displasia metafisaria senza ipotricosi; Ipoplasia cartilagine-capelli
Glaucoma congenito tipo 3A; Disgenesia mesenchimale familiare del segmento anteriore dell'occhio
Sindrome di Smith-Lemli-Opitz
Malattie correlate al gene POLG
Pneumopatia interstiziale da deficit di ABCA3
Albinismo oculare recessivo legato all'X; Nistagmo congenito tipo 6
Sindrome costa corta-polidattilia, tipo 3
Malattie correlate al gene TMEM67
Aciduria argininosuccinica
Distrofia Muscular di Duchenne; Distrofia muscolare di Becker
Malattia di Tay-Sachs
Miotonia congenita
Sordità autosomica recessiva tipo 3
Epidermolisi bollosa distrofica correlata al gene COL7A1
Ipopofosfatasia infantile
Distrofia muscolare degli arti tipo 2A
Sindrome di Pendred; Sordità autosomica recessiva tipo 4
Discinesia ciliare primaria tipo 3
Sindrome di Wiedemann-Rautenstrauch; Leucodistrofia ipomielinizzante tipo 7
Mucopolisaccaridosi tipo 2
Sindrome da rotture cromosomiche di Varsavia
Albinismo oculocutaneo tipo 4
Trombocitopenia amegacariocitica congenita tipo 1
Malattia di Canavan
Sindrome da insensibilità agli androgeni
Il metodo attuale non valuta le ripetizioni del trinucleotide CAG nell’esone 1 di questo gene.
Hemofilia B
Sindrome di Bardet-Biedl; Sindrome di Joubert; Sindrome di Meckel
Intolleranza ereditaria al fruttosio
Omocistinuria classica
Acromatopsia tipo 2
Malattie correlate al gene CEP290
La variante intronica profonda NM_025114.4:c.2991+1655A>G non è inclusa.
Acromatopsia tipo 3
Citrullinemia tipo 2
Disautonomia familiare
Sindrome di Wiskott-Aldrich; Neutropenia congenita grave legata all'X; Trombocitopenia legata all’X
Malattia da accumulo di glicogeno tipo 4; Malattia da corpi di poliglucosano dell'adulto
Sindrome da contratture congenite letali, tipo 1; Artrogriposi letale con malattia delle cellule delle corna anteriori
Sindrome idroletale
Sindrome di Ivemark
Deficit combinato della fosforilazione ossidativa tipo 3
Displasia ectodermica ipoidrotica tipo 1
Miopatia centronucleare legata al cromosoma X
Deficit di E3 della piruvato deidrogenasi
Malattie correlate al gene PRPS1
Sindrome di Alport tipo 1
Miopia tipo 6
Adrenomieloneuropatia
Coroideremia
Eterotassia legata al cromosoma X; VACTERL con idrocefalo
Malattia di Fabry
Malattie correlate al gene AIFM1
Sindrome IPEX
Retinoschisi
Aspartilglucosaminuria
Sindrome da deficit di creatina cerebrale tipo 1
Disturbo dello sviluppo intellettivo legato all'X tipo 1
Sindrome di Barth
Malattie correlate al gene MECP2
Sindrome di Joubert tipo 10
Lissencefalia, tipo 1; Eterotopia a banda sottocorticale
Sindrome del nanismo di Mulibrey
Sindrome linfoproliferativa legata all'X tipo 2
Epilessia legata all'X - disturbi dell'apprendimento - disturbi del comportamento; Disturbo dello sviluppo intellettivo legato all’X tipo 50
Deficit di ornitina transcarbamilasi
Sindrome FG, tipo 4; Disturbo dello sviluppo intellettivo legato all’X, tipo Najm
Sordità autosomica recessiva tipo 1B
Le varianti associate a un fenotipo lieve non vengono segnalate.
Eritrocheratodermia variabilis tipo 1
Le varianti associate a un fenotipo lieve non vengono segnalate.
Fenilchetonuria
Sordità autosomica recessiva tipo 1A
Le varianti associate a un fenotipo lieve non vengono segnalate.
Atrofia muscolare spinale
Viene inclusa solo la delezione dell’esone 7 nel gene SMN1. Non viene effettuata la sequenza né l’analisi di delezione/duplicazione in altre regioni di questo gene. Questo test non rileva portatori “silenziosi” di SMA, che hanno due copie del gene SMN1 su un cromosoma e nessuna sull’altro.
Deficit di diidropirimidina deidrogenasi
Deficit di acil-CoA deidrogenasi a catena media
Pseudoxantoma elastico; Calcificazione arteriosa generalizzata dell'infanzia tipo 2
Sindrome di Coats plus
Galattosemia
Hemofilia A
È inclusa anche la rilevazione dell’inversione dell’introne 22 nel gene F8.
Síndrome de Shwachman-Diamond tipo 1
Malattia di Niemann-Pick tipo A/B
Sindrome di Usher tipo 2A; Retinite pigmentosa tipo 39